MsCoreUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsCoreUtils

这是发展MsCoreUtils的版本;稳定版请参见MsCoreUtils．

质谱数据的核心Utils

Bioconductor版本:开发(3.17)

MsCoreUtils定义了用于质谱数据的低级函数，并且独立于任何高级数据结构。这些函数包括质谱处理函数(噪声估计，平滑，分节)，定量聚合函数(中位数优化，稳健摘要，…)，缺失数据imputation，数据归一化(分位数，vsn，…)以及misc辅助函数，这些函数在R for质谱包中的高级数据结构中使用。

作者:rformassspectra Package Maintainer [cre]， Laurent Gatto [aut]，约翰·雷纳[au]，塞巴斯蒂安·吉布[au]，阿德里安·斯蒂格[ctb]，西格杜尔·斯马森[ctb]，托马斯·纳克[ctb]，何塞普·玛丽亚·巴迪亚·阿帕里西奥[ctb]，迈克尔·威廷[ctb]， Samuel Wieczorek [ctb]

维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MsCoreUtils")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsCoreUtils”)

超文本标记语言	R脚本	质谱数据的核心Utils
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.11.3
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	方法,S4Vectors，质量统计数据,线索
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，roxygen2，imputeLCMD，嫁祸于，规范，norm2，pcaMethods，vsn，矩阵，preprocessCore，missForest
SystemRequirements
增强了	HDF5Array
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils/issues
全靠我
进口我	CompoundDb，MetaboAnnotation，MetaboCoreUtils，MetCirc，MsBackendMassbank，MsBackendMgf，MsBackendMsp，MsBackendRawFileReader，MsFeatures，MSnbase，PSMatch，QFeatures，qmtools，scp，光谱，xcms
建议我	MetNet，msqrob2
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsCoreUtils_1.11.3.tar.gz
Windows二进制	MsCoreUtils_1.11.3.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MsCoreUtils_1.11.3.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MsCoreUtils_1.11.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsCoreUtils
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsCoreUtils
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MsCoreUtils/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsCoreUtils/
软件包下载报告	下载数据