MsBackendRawFileReader

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendRawFileReader

这是发展MsBackendRawFileReader的版本;稳定版请参见MsBackendRawFileReader．

质谱后端阅读赛默飞世尔科学原始文件

Bioconductor版本:开发(3.17)

使用赛默飞世尔科技公司的NewRawFileReader . net库实现了spectrum包的MsBackend。该包泛化了由rawrr包引入的功能(Kockmann T. et al. (2020)) 本包中定义的方法应该扩展Spectra Bioconductor包。

作者:Christian Panse [aut, cre]，托拜厄斯·科克曼[aut]

维护者:Christian Panse

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MsBackendRawFileReader")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendRawFileReader”)

超文本标记语言	R脚本	关于使用和扩展' MsBackendRawFileReader '后端。
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文本		安装

细节

biocViews	MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 4.1)，方法，光谱(> = 1.5.8)
进口	MsCoreUtils，S4Vectors，IRanges，rawrr(>= 1.3.6)， utils，BiocParallel
链接
建议	BiocStyle(> = 2.5),ExperimentHub，MsBackendMgf，knitr，晶格，mzR，protViz(> = 0.7),rmarkdown，鞑靼(> = 1.5),testthat
SystemRequirements	mono-runtime 4。x或更高(包括System。数据库)在Linux/macOS， . net框架(>= 4.5.1)在微软Windows。
增强了
URL	https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader
BugReports	https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsBackendRawFileReader_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendRawFileReader_1.5.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MsBackendRawFileReader_1.5.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MsBackendRawFileReader_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendRawFileReader
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendRawFileReader
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendRawFileReader/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendRawFileReader/
软件包下载报告	下载数据