MsBackendMsp

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMsp

这是发展MsBackendMsp版本;稳定的发布版本,请参阅MsBackendMsp。

NIST质谱数据的后端msp文件

Bioconductor版本:发展(3.18)

质谱(MS)数据后端支持导入和处理MS / MS谱从NIST MSP格式(MSP)文件。从文件中导入的数据与不同的MSP *味道*支持。对象从这个包添加支持MSP文件Bioconductor光谱的包。这个包是不应该使用没有光谱方案,提供了一个完整的基础设施数据处理。

作者:纽曼史蒂芬(aut),Johannes Rainer (aut (cre),迈克尔情报(施)

维护人员:约翰Rainer <约翰内斯。在eurac.edu Rainer >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MsBackendMsp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MsBackendMsp”)

HTML	R脚本	MsBackendMsp
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0),光谱(> = 1.5.14)
进口	BiocParallel,S4Vectors,IRanges,MsCoreUtils、方法、统计数据
链接
建议	testthat knitr (> = 1.1.0) roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MsBackendMsp_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMsp_1.5.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MsBackendMsp_1.5.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MsBackendMsp_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMsp
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsBackendMsp
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendMsp/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMsp/
包下载报告	下载数据