msbackendmassbank

doi:10.18129/b9.bioc.msbackendmassbank

这是发展MSBACKENDMASSBANK的版本;对于稳定版本,请参阅msbackendmassbank

Massbank记录文件的质谱数据后端

生物导体版本:开发(3.16)

质谱(MS)数据后端支持Massbank记录文件的MS/MS库光谱导入和导出。可以使用不同的后端,可以以普通的Massbank文本文件格式处理数据,或者还允许直接与Massbank SQL数据库进行交互。该软件包中的对象应该与光谱生物导体软件包一起使用。因此,此软件包为Spectra包增加了Massbank的支持。

作者:rformassspectrometry package naverer [cre],迈克尔·威特(Michael Witting)[aut],约翰内斯·雷纳[AUT],迈克尔·斯特拉夫[CTB]

维护器:rformassspectrometry package naverer

引用(从r内,输入引用(“ msbackendmassbank”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ msbackendmassbank”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ msbackendmassbank”)

html R脚本 MSBACKENDMASSBANK的描述和使用
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,软件
版本 1.5.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.0),光谱(> = 1.5.17)
进口 生物比较,,,,S4VECTORS,,,,iranges, 方法,蛋白质,,,,mscoreutils,,,,DBI,UTILS
链接
建议 测试,,,,尼特(> = 1.1.0),roxygen2,,,,生物使用(> = 2.5.19),rsqlite,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/rformassspectrometry/msbackendmassbank
BugReports https://github.com/rformassspectrometry/msbackendmassbank/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 msbackendmassbank_1.5.0.tar.gz
Windows二进制 msbackendmassbank_1.5.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) msbackendmassbank_1.5.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msbackendmassbank
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/msbackendmassbank
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/msbackendmassbank/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网