这是发展MSBACKENDMASSBANK的版本;对于稳定版本,请参阅msbackendmassbank。
生物导体版本:开发(3.16)
质谱(MS)数据后端支持Massbank记录文件的MS/MS库光谱导入和导出。可以使用不同的后端,可以以普通的Massbank文本文件格式处理数据,或者还允许直接与Massbank SQL数据库进行交互。该软件包中的对象应该与光谱生物导体软件包一起使用。因此,此软件包为Spectra包增加了Massbank的支持。
作者:rformassspectrometry package naverer [cre],迈克尔·威特(Michael Witting)[aut],约翰内斯·雷纳[AUT],迈克尔·斯特拉夫[CTB]
维护器:rformassspectrometry package naverer
引用(从r内,输入引用(“ msbackendmassbank”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ msbackendmassbank”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ msbackendmassbank”)
html | R脚本 | MSBACKENDMASSBANK的描述和使用 |
参考手册 |
生物浏览 | DataImport,,,,基础设施,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,软件 |
版本 | 1.5.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.13(R-4.1)(1年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 4.0),光谱(> = 1.5.17) |
进口 | 生物比较,,,,S4VECTORS,,,,iranges, 方法,蛋白质,,,,mscoreutils,,,,DBI,UTILS |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特(> = 1.1.0),roxygen2,,,,生物使用(> = 2.5.19),rsqlite,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/rformassspectrometry/msbackendmassbank |
BugReports | https://github.com/rformassspectrometry/msbackendmassbank/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | msbackendmassbank_1.5.0.tar.gz |
Windows二进制 | msbackendmassbank_1.5.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | msbackendmassbank_1.5.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msbackendmassbank |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/msbackendmassbank |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msbackendmassbank/ |
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