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从主题和ChIP-seq实验检测结合位点,并在条件比较结合位点

Bioconductor版本:发展(3.17)

检测使用IUPAC图案序列结合位点或床上坐标和ChIP-seq实验在床上或bam格式。上的结合位点结合/比较实验,组织,或条件。所有标准化和微分使用TMM-GLM方法步骤做。信号分解是通过设置图案的中心的混合正态分布曲线。

作者:Peyman Zarrineh (cre, aut)

维护人员:Peyman Zarrineh < Peyman。在manchester.ac.uk zarrineh >

从内部引用(R,回车引用(“Motif2Site”)):

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下initializ