MobilityTransformR

DOI:10.18129 / B9.bioc.MobilityTransformR

这是发展mobilitytransformer版本;稳定版请参见MobilityTransformR．

CE-MS(/MS)数据的有效迁移量表转换

Bioconductor版本:开发(3.16)

mobilitytransformer收集了一个工具集，用于CE-MS/MS数据的有效移动规模转换，以提高可重复性。它提供了从添加到分析中的移动标记确定迁移时间的功能，并基于这些标记执行转换。mobilitytransformer支持数值向量、频谱对象和MSnOnDiskExp的转换。

作者:Liesa Salzer

维护者:Liesa Salzer < Liesa。Salzer在helmholtz-muenchen.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" mobilitytransformer ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MobilityTransformR”)

超文本标记语言	R脚本	mobilitytransformer的描述和使用
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,预处理,蛋白质组学,软件
版本	1.1.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	MSnbase， r (>= 4.2)
进口	xcms,MetaboCoreUtils,光谱
链接
建议	testthat,msdata(> = 0.35.3),knitr(> = 1.1.0版),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LiesaSalzer/MobilityTransformR
BugReports	https://github.com/LiesaSalzer/MobilityTransformR/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MobilityTransformR_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	MobilityTransformR_1.1.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MobilityTransformR_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MobilityTransformR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ mobilitytransformer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MobilityTransformR/
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