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海市蜃楼
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MiRaGE
这是发展版本的海市蜃楼;稳定的发布版本请参见海市蜃楼。
MiRNA按基因表达排序
生物导体版本:开发(3.13)
该包包含推断靶基因调控miRNA的功能，仅基于靶基因的表达谱。
作者:Y-h。Taguchi <标签granular.com>
维护人员:Y-h。Taguchi <标签granular.com>
引文(从R中输入引用(“海市蜃楼”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装。packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MiRaGE")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“海市蜃楼”)
| R脚本 | 海市蜃楼包装如何使用 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,圣人,测序,软件 |
| 版本 | 1.33.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.1.0),Biobase(> = 2.23.3) |
| 进口 | BiocGenerics,S4Vectors,AnnotationDbi,BiocManager |
| 链接 | |
| 建议 | seqinr(> = 3.0.7),biomaRt(> = 2.19.1),GenomicFeatures(> = 1.15.4),Biostrings(> = 2.31.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,miRNATarget,humanStemCell,IRanges,GenomicRanges(> = 1.8.3),BSgenome,beadarrayExampleData |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | MiRaGE_1.33.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MiRaGE_1.33.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | MiRaGE_1.33.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MiRaGE |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/海市蜃楼 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MiRaGE/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
