metaboIgnal.

DOI：10.18129 / b9.bioc.metaboSignal.

这是发展MetaboSignal的版本;对于稳定的版本版本，请参阅metaboIgnal.。

MetaboSignal：基于网络的覆盖方法和探索代谢和信令Kegg路径的方法

Bioconducts版本：开发（3.14）

MetaboIgnal是R包，允许合并，分析和定制代谢和信令Kegg路径。它是一种基于网络的方法，旨在探讨基因（信令或酶 - 基因）和代谢物之间的拓扑关系，代表了调查代谢表型的遗传景观和监管网络的强大工具。

作者：Andrea Rodriguez-Martinez，Rafael Ayala，Joram M. Posma，Ana L. Neves，Maryam Anwar，Jeremy K. Nicholson，Marc-Emmanueld Dumas

维护者：Andrea Rodriguez-Martinez ，Rafael Ayala

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）＃下面初始化buoc devel biocmanager :: install的用法（版本='devel'）biocmanager ::安装（“metaboSignal”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“MetaboSignal”）

HTML.	r script.	metaboIgnal.
HTML.	r script.	MetaboIgnal 2：与额外的交互资源合并Kegg
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	Genesignaling.那geetarget.那graphandnetwork.那ke那网络那途径那反应那软件
版本	1.23.0
在生物导体中以来	BIOC 3.4（R-3.3）（4.5岁）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 3.3）
进口	keggraph.那HPAR.那iGraph.那rcurl.那凯格斯特，ensdb.hsapiens.v75，stats，图形，utils，org.hs.eg.db，生物雕那annotationdbi.那mwastools.那mygene.
链接到
建议	运行那生物根系那kn那生物焦那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	metaboSignal_1.23.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	metaboSignal_1.23.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/metaboSignal.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ metaboIgnal
包短网址	https://biocumon.org/packages/metaboSignal/
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