MetaboCoreUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaboCoreUtils

这是发展MetaboCoreUtils版本;稳定的发布版本,请参阅MetaboCoreUtils。

代谢组学数据的核心跑龙套

Bioconductor版本:发展(3.17)

MetaboCoreUtils定义metabolomics-related核心功能提供低级功能允许数据structure-independent使用跨各种R包。这包括离子加合物和化合物之间的函数来计算质荷比和质量或功能与化学公式。包还提供了一组加合物的定义和信息在一些商用内标混合女士常用于实验。

作者:约翰Rainer (aut (cre),迈克尔情报(aut)沙尔茨,安德里亚·维克尼(aut) Liesa(施)Sebastian吉布(施),迈克尔Stravs(施),罗杰(aut)发动机是否有

维护人员:约翰Rainer <约翰内斯。在eurac.edu Rainer >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MetaboCoreUtils”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MetaboCoreUtils”)

HTML	R脚本	代谢组学数据的核心跑龙套
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0)
进口	跑龙套,MsCoreUtils
链接
建议	BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MetaboCoreUtils
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MetaboCoreUtils/issues
取决于我
进口我	CompoundDb,MetaboAnnotation,MobilityTransformR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MetaboCoreUtils_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	MetaboCoreUtils_1.7.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MetaboCoreUtils_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MetaboCoreUtils_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaboCoreUtils
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MetaboCoreUtils
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MetaboCoreUtils/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaboCoreUtils/
包下载报告	下载数据