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- Bioconductor 3.17
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- MSstatsLiP(开发版)
MSstatsLiP
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsLiP
这是发展MSstatsLiP版本;稳定的发布版本,请参阅MSstatsLiP。
唇意义分析猎枪质量spectrometry-based蛋白质组学实验
Bioconductor版本:发展(3.17)
唇肽和蛋白质的意义分析的工具。为总结提供了功能,嘴唇肽丰富,估计和检测条件的变化。利用整个MSstats家庭包的功能。
作者:德文郡科勒(aut (cre) Tsung-Heng蔡(aut) Ting黄(aut) Mateusz Staniak (aut)之一Meena崔(aut),瓦伦蒂娜意大利水饺(aut),莉莉安娜Malinovska (aut),奥尔加Vitek (aut)
维护人员:德文郡科勒<科勒。d: northeastern.edu >
从内部引用(R,回车引用(“MSstatsLiP”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MSstatsLiP”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MSstatsLiP”)
| HTML | R脚本 | MSstatsLiP蛋白水解工作流 |
| HTML | R脚本 | MSstatsLiP工作流:MSstatsLiP包的工作流和分析一个例子 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,ImmunoOncology,MassSpectrometry,归一化,OneChannel,蛋白质组学,质量控制,软件,TwoChannel |
| 版本 | 1.5.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | dplyr,gridExtra,stringr,ggplot2grDevices,MSstats,MSstatsConvert,data.table,Biostrings,MSstatsPTM,Rcpp,使彻底失败,factoextra,ggpubr,purrr,宠物猫,tidyr,tidyverse,尺度,统计数据 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,covr,tinytest,gghighlight |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsLiP/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MSstatsLiP_1.5.1.tar.gz |
| Windows二进制 | MSstatsLiP_1.5.1.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | MSstatsLiP_1.5.1.tgz |
| macOS二进制(arm64) | MSstatsLiP_1.5.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsLiP |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstatsLiP |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsLiP/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsLiP/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
