MSSTATS

doi:10.18129/b9.bioc.msstats

这是发展MSSTATS的版本;对于稳定版本,请参阅MSSTATS

DDA,SRM和DIA中的蛋白质显着性分析,用于无标签或基于标签的蛋白质组学实验

生物导体版本:开发(3.16)

DDA,SRM和DIA实验中的一组用于统计相对蛋白质显着性分析的工具。

作者:Meena Choi [AUT,CRE],Mateusz Staniak [aut],Tsung-heng Tsai [aut],Ting Huang [aut],Olga Vitek [aut]

维护者:meena choi

引用(从r内,输入引用(“ MSSTATS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ msstats”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ MSSTATS”)

html R脚本 MSSTAT:蛋白质/肽的显着性分析
PDF 参考手册

细节

生物浏览 免疫学,,,,质谱,,,,正常化,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件,,,,时间科
版本 4.5.1
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(9年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 4.0)
进口 MSSTATSConvert,,,,Data.Table,,,,检查员,,,,大量的,,,,林玛,,,,LME4,,,,预处理,,,,生存,utils,RCPP,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,GPLOTS,,,,Marray,统计,grdevices,图形,方法
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,很小的测试,,,,COVR,,,,降价
系统要求
增强
URL http://msstats.org
BugReports https://groups.google.com/forum/#! Forum/msstats
取决于我
进口我 Artms,,,,MSSTATSLIP,,,,MSSTATSPTM,,,,msstatssamples,,,,MSSTATSTMT
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 msstats_4.5.1.tar.gz
Windows二进制 msstats_4.5.1.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) msstats_4.5.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msstats
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/msstats
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/msstats/
软件包下载报告 下载统计

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