MSNBase

doi：10.18129/b9.bioc.msnbase

这是发展MSNBase的版本；对于稳定版本，请参阅MSNBase。

质谱和蛋白质组学的基础功能和类

生物导体版本：开发（3.16）

MSNBase提供了质谱和蛋白质组学数据的操纵，处理和可视化的基础架构，从原始到定量和注释数据。

Author: Laurent Gatto, Johannes Rainer and Sebastian Gibb with contributions from Guangchuang Yu, Samuel Wieczorek, Vasile-Cosmin Lazar, Vladislav Petyuk, Thomas Naake, Richie Cotton, Arne Smits, Martina Fisher, Ludger Goeminne, Adriaan Sticker and Lieven Clement.

维护者：laurent Gatto

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ msnbase”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ msnbase”）

html	R脚本	“ MSNBase”开发的简短介绍
html	R脚本	基于MS的蛋白质组学的基本功能和类
html	R脚本	MSNBase基准测试
html	R脚本	MSNBase IO功能
html	R脚本	MSNBase：centroding copers-Mode MS数据
PDF		参考手册

细节

生物浏览	DataImport，，，，免疫学，，，，基础设施，，，，质谱，，，，蛋白质组学，，，，QualityControl，，，，软件
版本	2.23.0
在生物导体中	Bioc 2.8（R-2.13）（11。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5），方法，生物基因（> = 0.7.1），生物酶（> = 2.15.2），MZR（> = 2.29.3），S4VECTORS，，，，蛋白质（> = 1.27.2）
进口	mscoreutils，，，，生物比较，，，，iranges（> = 2.13.28），plyr，，，，VSN，网格，Stats4，副词，，，，算，，，，pcamethods，，，，害怕（> = 1.16），mzid（> = 1.5.2），消化，，，，格子，，，，GGPLOT2，，，，XML，，，，秤，，，，大量的，，，，RCPP
链接	RCPP
建议	测试，，，，普里尔，，，，栅格，，，，微实验，，，，动物园，，，，尼特（> = 1.1.0），洛尔，，，，rdisop，，，，proloc，，，，prolocdata（> = 1.7.1），MSDATA（> = 0.19.3），roxygen2，，，，RGL，，，，rpx，，，，AnnotationHub，，，，生物使用（> = 2.5.19），rmarkDown，，，，IMPUTELCMD，，，，规范，，，，GPLOTS，，，，闪亮的，，，，马格里特，，，，总结性特征
系统要求
增强
URL	https://lgatto.github.io/msnbase
BugReports	https://github.com/lgatto/msnbase/issues
取决于我	班尔，，，，metcirc，，，，MobilityTransFormr，，，，MSMSEDA，，，，msmstests，，，，proloc，，，，prolocdata，，，，Prolocgui，，，，QPLEXANALYZER，，，，rforpoteomics，，，，突触，，，，XCMS
进口我	集团，，，，clumsid，，，，达帕尔，，，，Dapardata，，，，dep，，，，MSNID，，，，MSSTATSQC，，，，峰板，，，，王子，，，，ptairms，，，，qplexdata，，，，rmassbank，，，，TopDownr
建议我	AnnotationHub，，，，生物室，，，，生物基因，，，，isobar，，，，MSDATA，，，，M型，，，，MSQROB2，，，，Proda，，，，QCMetrics，，，，WPM
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	msnbase_2.23.0.tar.gz
Windows二进制	msnbase_2.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	msnbase_2.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msnbase
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/msnbase
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/msnbase/
软件包下载报告	下载统计