Migsa

doi：10.18129/b9.bioc.migsa

这是发展Migsa的版本；对于稳定版本，请参阅Migsa。

大规模和综合基因集分析

生物导体版本：开发（3.16）

大规模和综合基因集分析。MIGSA软件包允许对几个表达和基因集进行大规模综合基因集分析。它提供了一个常见的基因表达分析框架，该框架授予了全面和连贯的分析。仅需要一个最小的用户参数设置才能通过最佳可用方法（即Denricher和MGSZ）以整合方式进行单数和基因集富集分析。该大型OMIC数据工具的最大优势是可以探索，分析和可视化其结果的几种功能，以便在大量信息源上促进数据挖掘任务。MIGSA软件包还提供了几个功能，可以轻松加载来自几个存储库的最新基因集。

作者：Juan C. Rodriguez，Cristobal Fresno，Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者：Juan C. Rodriguez

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ migsa”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Migsa”）

PDF	R脚本	获取PBCMC数据集
PDF	R脚本	获取TCGA数据集
PDF	R脚本	大规模和综合基因集分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基因表达，，，，基因烯，，，，kegg，，，，微阵列，，，，rnaseq，，，，软件，，，，可视化
版本	1.21.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 3.4），方法，生物基因
进口	AnnotationDbi，，，，生物酶，，，，生物比较，编译器，Data.Table，，，，EDGER，，，，徒劳，，，，ggdendro，，，，GGPLOT2，，，，go.db，，，，gostats，，，，图形，图形，grdevices，网格，gseabase，，，，ISMEV，，，，jsonlite，，，，林玛，，，，矩阵，，，，org.hs.eg.db，，，，rbgl，，，，RESHAPE2，，，，rgraphviz，统计，utils，素食主义者
链接
建议	生物使用，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，乳腺癌，，，，尼特，mgsz，Migsadata，，，，运行
系统要求
增强
URL	https://github.com/jcrodriguez1989/migsa/
BugReports	https://github.com/jcrodriguez1989/migsa/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	migsa_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	migsa_1.21.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	migsa_1.21.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/migsa
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/migsa
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/migsa/
软件包下载报告	下载统计