- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- MEDME(开发版)
MEDME
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MEDME
这是发展MEDME版本;稳定的发布版本,请参阅MEDME。
造型从MeDIP浓缩实验数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
MEDME允许绝对和相对的甲基化水平的预测基于MeDIP-microarray实验获得的措施
作者:马狄亚和安妮特·莫里纳罗
维护人员:马狄亚< Mattia。裴里荣拉gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“MEDME”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MEDME”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MEDME”)
| R脚本 | MEDME.pdf | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CpGIsland,DNAMethylation,微阵列,软件 |
| 版本 | 1.59.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.3 (r - 2.8)(14.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.15), grDevices,图形,方法,属性,跑龙套 |
| 进口 | Biostrings,质量,刚果民主共和国 |
| 链接 | |
| 建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MEDME_1.59.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MEDME_1.59.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | MEDME_1.59.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | MEDME_1.59.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MEDME |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MEDME |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MEDME/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MEDME/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
