餐

DOI:10.18129 / B9.bioc.MEAL

这是发展MEAL版;稳定版请参见餐．

进行甲基化分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

包集成甲基化和表达数据。它也可以单独进行甲基化或表达分析。包括了一些绘图功能，以及基于冗余分析的新的区域分析。snp对一个区域的影响也可以被估计。

作者:Carlos Ruiz-Arenas [aut, cre]， Juan R. Gonzalez [aut]

维护者:Xavier Escribà Montagut

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MEAL")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	DNAMethylation，微阵列，软件，WholeGenome
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6.0)，Biobase，MultiDataSet
进口	GenomicRanges，limma，素食主义者，BiocGenerics，minfi，IRanges，S4Vectors，方法，并行，ggplot2(> = 2.0.0),交换，Gviz，missMethyl，isva，SummarizedExperiment，SmartSVA，图形，统计，utils，matrixStats
链接
建议	testthat，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，knitr，minfiData，BiocStyle，rmarkdown，brgedata
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)	MEAL_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MEAL
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MEAL
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MEAL/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MEAL/
软件包下载报告	下载数据