这是发展MDTS版本;稳定版请参见联合化疗.
Bioconductor版本:开发(3.16)
一种高灵敏度和阳性预测价值的检测试剂盒,用于检测三联体靶向测序中的从头拷贝数缺失。
作者:Jack M..Fu [aut, cre]
维护者:Jack M..Fu
引文(从R内,输入引用(“联合化疗”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MDTS")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“联合化疗”)
超文本标记语言 | R脚本 | 小品的标题 |
参考手册 |
biocViews | 报道,DataImport,测序,软件,StatisticalMethod,TargetedResequencing,技术 |
版本 | 1.17.0 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | GenomicAlignments,GenomicRanges,IRanges,Biostrings,DNAcopy,Rsamtools平行,stringr |
链接 | |
建议 | testthat,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MDTS_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | MDTS_1.17.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | MDTS_1.17.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MDTS |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MDTS |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MDTS/ |
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