这是发展MCbiclust版本;稳定版请参见MCbiclust.
Bioconductor版本:开发(3.17)
定制的算法和相关方法,用于发现,可视化和分析大型基因表达数据集中的双簇。算法基于提供的大小为n的基因集,从数据集中寻找包含m个样本的最大强度相关矩阵。
作者:罗伯特·边沁
维护者:Robert Bentham < Robert . Bentham。11在ucl.ac.uk>
引文(从R内,输入引用(“MCbiclust”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MCbiclust")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MCbiclust”)
超文本标记语言 | R脚本 | MCbiclust介绍 |
参考手册 |
biocViews | 聚类,GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.23.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | BiocParallel,图形,utils,统计,AnnotationDbi,GO.db,org.Hs.eg.db,GGally,ggplot2,尺度,集群,WGCNA |
链接 | |
建议 | gplots,knitr,rmarkdown,BiocStyle,gProfileR,质量,dplyr,老鸨,devtools,testthat,GSVA |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MCbiclust_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | MCbiclust_1.23.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | MCbiclust_1.23.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | MCbiclust_1.23.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MCbiclust |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MCbiclust |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MCbiclust/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MCbiclust/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |