mbt

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBttest

这是发展mbt的版本;稳定的发布版本,请参阅mbt。

多个βt

Bioconductor版本:发展(3.18)

mbt方法由βt Baggerly et al(2003)的方法。相比baySeq(硬城堡和凯利2010年),DESeq(2010年安德斯和Huber)和准确的测试(罗宾逊2007年史密斯,2008)和麦卡锡et al(2012)的漠视,mbt高工作效率,也就是说,它具有高功率,高罗斯福的保守估计和高稳定性。mbt是西装——能够转录组数据,标记数据,SAGE数据(统计数据)小样本或几个复制库。它可以用来识别基因,信使rna亚型或标签两种情况之间的差异表达。

作者:Yuan-De谭

维护人员:Yuan-De Tan < tanyuande gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(mbt)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (mbt)

PDF	R脚本	分析与“mbt”包RNA-Seq计数数据
PDF		MBttest-manual.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,MultipleComparison,圣人,测序,软件,转录
版本	1.27.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 3.3.0),统计,gplots, gtools,图形,基地,跑龙套,grDevices
进口
链接
建议	BiocStyle,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MBttest_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	MBttest_1.27.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBttest
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mbt
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MBttest/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MBttest/
包下载报告	下载数据