工商管理硕士

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBASED

这是发展mbase版本;稳定版请参见工商管理硕士

包包含功能ASE分析使用元分析基于等位基因特异性表达检测

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包实现了mbase算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中单个位点(SNVs)上的等位基因计数被集成到ASE的基因特异性测量中,并利用模拟适当地评估所观察到的ASE的统计显著性。

作者:奥列格·梅巴,休斯顿·吉尔伯特

维护者:Oleg Mayba < Mayba。奥列格在gene.com>

引文(从R内,输入引用(mba)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MBASED")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (mba)

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文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression测序软件转录
版本 1.33.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 RUnitBiocGenericsBiocParallelGenomicRangesSummarizedExperiment
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MBASED_1.33.0.tar.gz
Windows二进制 MBASED_1.33.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) MBASED_1.33.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) MBASED_1.33.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBASED
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ mbase
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MBASED/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MBASED/
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Bioconductor

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网