工商管理硕士

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBASED

这是发展mbase版本;稳定版请参见工商管理硕士．

包包含功能ASE分析使用元分析基于等位基因特异性表达检测

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包实现了mbase算法，用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达，其中单个位点(SNVs)上的等位基因计数被集成到ASE的基因特异性测量中，并利用模拟适当地评估所观察到的ASE的统计显著性。

作者:奥列格·梅巴，休斯顿·吉尔伯特

维护者:Oleg Mayba < Mayba。奥列格在gene.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MBASED")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (mba)

PDF	R脚本	工商管理硕士
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，测序，软件，转录
版本	1.33.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	RUnit，BiocGenerics，BiocParallel，GenomicRanges，SummarizedExperiment
进口
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MBASED_1.33.0.tar.gz
Windows二进制	MBASED_1.33.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MBASED_1.33.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MBASED_1.33.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBASED
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ mbase
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MBASED/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MBASED/
软件包下载报告	下载数据