MACSr

DOI:10.18129 / B9.bioc.MACSr

这是发展MACSr版本;稳定的发布版本,请参阅MACSr。

ChIP-Seq mac:基于模型的分析

Bioconductor版本:发展(3.17)

ChIP-Seq的基于模型的分析(mac)是一种广泛使用的工具包,用于识别转录因子结合位点。这个包是一个R的最新MACS3的包装器。

作者:羌胡(aut (cre)

维修工:羌胡<羌族。胡在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“MACSr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MACSr”)

HTML	R脚本	MACSr
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	ATACSeq,ChIPSeq,ImmunoOncology,软件
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	跑龙套,网状,S4Vectors、方法、蛇怪,ExperimentHub,AnnotationHub
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,MACSdata
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MACSr_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)	MACSr_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MACSr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MACSr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MACSr/
包下载报告	下载数据