- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- LowMACA(开发版)
LowMACA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.LowMACA
这是发展LowMACA版本;稳定的发布版本,请参阅LowMACA。
通过共识对齐LowMACA -低频变异分析
Bioconductor版本:发展(3.17)
LowMACA包是一个简单的工具来调查和分析几种蛋白质的突变概要或包含域通过共识对齐。你可以使用我们的包进行假说驱动的探索性分析提供一组基因或域包含了你的兴趣。
作者:乔治•Melloni,斯特凡诺德Pretis
维护人员:乔治•Melloni < Melloni。乔治在gmail.com >,斯特凡诺德Pretis < ste.depo gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“LowMACA”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“LowMACA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 对齐,DataImport,MultipleSequenceAlignment,SequenceMatching,测序,软件,SomaticMutation,WholeGenome |
| 版本 | 1.29.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(8年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10) |
| 进口 | cBioPortalData平行,stringr,reshape2,data.table,RColorBrewer、方法、LowMACAAnnotation,BiocParallel,motifStack,Biostrings,httr、网格gridBase,plyr |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | clustalo、gs、perl |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | LowMACA_1.29.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | LowMACA_1.29.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LowMACA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LowMACA |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/LowMACA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LowMACA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
