这是发展LinkHD版本;稳定的发布版本,请参阅LinkHD。
Bioconductor版本:发展(3.18)
我们现在Link-HD方法集成异构数据集,STATIS-ACT的泛化(“结构化des舞台造型三个指标de la Statistique-Analyse Conjointe de舞台造型”),一个家庭的方法加入从多个子空间和比较信息。然而,STATIS-ACT有一些缺陷,因为它只允许连续数据,无法建立样本和特征之间的关系。为了解决这些限制,我们把多个距离选项和一个基于线性回归的Biplot模型为了坚固观察和选择变量和执行变量之间的关系。
作者:劳拉·m·Zingaretti (aut (cre)
维护人员:“劳拉M Zingaretti”< m.lau。在gmail.com zingaretti >
从内部引用(R,回车引用(“LinkHD”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“LinkHD”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“LinkHD”)
HTML | R脚本 | 注释的基因变异 |
参考手册 |
biocViews | 分类,MultipleComparison,回归,软件 |
版本 | 1.15.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(3.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(> = 3.6.0)、方法ggplot2,统计数据 |
进口 | 尺度、集群、图形、ggpubr gridExtra,素食,里约热内卢,MultiAssayExperiment,reshape2 emmeans data.table |
链接 | |
建议 | 质量(> = 7.3.0)、knitr rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | LinkHD_1.15.0.tar.gz |
Windows二进制 | LinkHD_1.15.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | LinkHD_1.15.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | LinkHD_1.15.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LinkHD |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LinkHD |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/LinkHD/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LinkHD/ |
包下载报告 | 下载数据 |