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- Bioconductor 3.16
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- KinSwingR(开发版)
KinSwingR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.KinSwingR
这是发展KinSwingR版本;稳定的发布版本,请参阅KinSwingR。
KinSwingR:基于网络的激酶活性预测
Bioconductor版本:发展(3.16)
质谱仪KinSwingR phosphosite集成数据来源于数据和kinase-substrate预测预测激酶活性。几个函数允许用户建立PWM kinase-subtrates模型,统计推断PWM:基质匹配,并整合这些数据来推断激酶活性。
作者:阿什利·j·Waardenberg (aut (cre)
维护人员:阿什利·j . Waardenberg <。在gmail.com waardenberg >
从内部引用(R,回车引用(“KinSwingR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“KinSwingR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“KinSwingR”)
| HTML | R脚本 | KinSwingR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 网络,蛋白质组学,SequenceMatching,软件 |
| 版本 | 1.15.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | data.table,BiocParallel,sqldf、统计数据、网格grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | KinSwingR_1.15.0.tar.gz |
| Windows二进制 | KinSwingR_1.15.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | KinSwingR_1.15.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KinSwingR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KinSwingR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/KinSwingR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
