KEGGREST

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGREST

这是发展KEGGREST版本;稳定的发布版本请参见KEGGREST。

京都基因和基因组百科全书(KEGG)的客户端REST访问

生物导体版本:开发(3.13)

一个为京都基因和基因组百科全书(KEGG) REST服务器提供客户端接口的包。基于KEGGSOAP的J. Zhang, R. Gentleman，和Marc Carlson，和KEGG (python包)的Aurelien Mazurie。

作者:Dan Tenenbaum [aut]， Jeremy Volkening [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [aut, cre]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("KEGGREST")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGREST”)

超文本标记语言	R脚本	访问KEGG REST API
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,KEGG,通路,软件,ThirdPartyClient
版本	1.31.1
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	方法,httr,png,Biostrings
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GeneAnswers,Hiiragi2013,ROntoTools
进口我	亚当,adSplit,AnnotationDbi,吸引,BiocSet,ChIPpeakAnno,cn,EnrichmentBrowser,famat,小伙子,计,KEGGlincs,KEGGprofile,MetaboSignal,MWASTools,NoRCE,PADOG,pathview,RnaSeqSampleSize,SBGNview,击杀,transomics2cytoscape,YAPSA
建议我	类别,categoryCompare,GenomicRanges,globaltest,iSEEu,中长期规划,莲花,RTopper
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	KEGGREST_1.31.1.tar.gz
Windows二进制	KEGGREST_1.31.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	KEGGREST_1.31.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGREST
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KEGGREST
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGREST/
包下载报告	下载数据