这是发展Interactivecomplexheatmap的版本;对于稳定版本,请参阅Interactivecomplexheatmap。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包可以轻松地制作由复杂HeatMap软件包生成的热图中的交互式应用程序。它提供了两种类型的交互式:1。在交互式图形设备上,以及2.在闪亮的应用程序上。它还提供了整合交互式热图小部件的功能,以进行更复杂的闪亮应用程序开发。
维护者:Zuguang gu
引用(从r内,输入引用(“ Interactivecomplexheatmap”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version(version ='devel')biocmanager :: InteractivecomplexheatMap”的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ InteractiveComplexHeatMap”)
html | R脚本 | 1.如何互动地可视化热图 |
html | R脚本 | 2.如何实施交互式复杂热图 |
html | R脚本 | 3.闪亮应用程序开发的功能 |
html | R脚本 | 4.热图上的装饰 |
html | R脚本 | 5.相互作用的热图间接地由Pheatmap(),Heatmap.2()和Heatmap()生成 |
html | R脚本 | 6.可视化DESEQ2结果的闪亮应用程序 |
html | R脚本 | 7.从头开始实施交互式热图 |
html | R脚本 | 8.与合作者分享交互式热图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.5.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.13(R-4.1)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | r(> = 4.0.0),复杂的图像(> = 2.11.0) |
进口 | grdevices,统计闪亮的, 网格,getoptlong,,,,S4VECTORS(> = 0.26.1),消化,,,,iranges,,,,KableExtra(> = 1.3.1),utils,svglite,,,,htmltools,,,,clisymbols,,,,jsonlite,,,,rcolorbrewer,,,,fontawesome |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,富集图,,,,基因组机,,,,Data.Table,,,,循环,,,,GenomicFeatures,,,,平淡无奇,,,,tidyheatmap,,,,簇,,,,org.hs.eg.db,,,,简化,,,,go.db,,,,SC3,,,,goexpress,,,,Singlecellexperiment,,,,评分,,,,GPLOTS,,,,pheatmap,,,,呼吸道,,,,deseq2,,,,DT,,,,可乐,,,,生物管理器,,,,网格文本,,,,Hilbertcurve(> = 1.21.1),发光的dashboard,,,,总结性特征,,,,pkgndep,,,,KS |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/jokergoo//interactivecomplexheatmap |
BugReports | https://github.com/jokergoo//interactivecomplexheatmap/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 简化 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Interactivecomplexheatmap_1.5.0.tar.gz |
Windows二进制 | Interactivecomplexheatmap_1.5.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Interactivecomplexheatmap_1.5.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interactivecomplexheatmap |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/Interactivecomplexheatmap |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/interactivecomplexheatmap/ |
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