免疫思考

DOI：10.18129 / b9.bioc.immunespacer

这是发展免疫素质版本;对于稳定的版本版本，请参阅免疫思考。

免疫空间数据库周围的薄包装

Bioconducts版本：开发（3.14）

提供一种方便的API，用于访问免疫空间（www.immunespace.org）中的数据集（www.immunespace.org），数据存储库和人类免疫学项目联盟（HIPC）的分析平台。

作者：greg finak [aut]，renan sauteraud [aut]，mike jiang [aut]，gil guday [aut]，leo dashevskiy [aut]，evan henrich [aut]，ju yeong金[aut]，lauren wolfe [aut]，Helen Miller [Aut]，Raphael Gottardo [Aut]，免疫空间包维护者[CRE，CPH]

维护者：免疫空情包维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！carcenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）＃下面初始化buoc devel biocmanager :: install的用法（版本='devel'）biocmanager ::安装（“免疫信徒”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“免疫信徒”）

HTML.	r script.	免疫型包装介绍
HTML.	r script.	使用getDataset下载数据集
HTML.	r script.	用免疫响应器处理表达矩阵
HTML.	r script.	Interactive_NETRC（）函数演练
HTML.	r script.	SDY144：HAI /病毒中立滴度和细胞计数的相关性
HTML.	r script.	SDY180：多次流式细胞术测量的丰度
HTML.	r script.	SDY269：将海与流式细胞仪和ELISPOT结果相关
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	DataImport.那datarepresentation那软件那第三个龙客
版本	1.21.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.5.0）
进口	Utils，R6.那data.table.那卷曲那httr.那rlabkey.（> = 2.3.1），BioBase.那Pheatmap.那ggplot2.（> = 3.2.0），秤，统计，贡献那情节那热克服（> = 0.7.0），雅思石那RAMAMAMDOW.那预处理核那流量计那FlowWorkspace.那消化
链接到
建议	kn那testthat.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/rglab/immunespacer.
Bugreports.	https://github.com/rglab/immunespacer/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	免疫缺款_1.21.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	免疫_21.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/immunespacer.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/免疫型器
包短网址	https://biocumon.org/packages/immunespacer/
包裹下载报告	下载统计信息