IWTomics

DOI:10.18129 / B9.bioc.IWTomics

这是发展IWTomics版本;稳定的发布版本,请参阅IWTomics。

Interval-Wise组学数据的测试

Bioconductor版本:发展(3.18)

实现Interval-Wise测试(IWT)的组学数据。这个推论过程测试两组之间的“组学”数据的差异基因区域(或一群基因组区域间和一个参考中心对称),并且不需要固定的位置和规模在一开始。

作者:Marzia克雷莫纳,Alessia扎,弗兰西斯卡Chiaromonte,西蒙Vantini

维护人员:Marzia克雷莫纳< mac78 psu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“IWTomics”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“IWTomics”)

PDF	R脚本	介绍IWTomics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DifferentialExpression,DifferentialMethylation,DifferentialPeakCalling,GenomeAnnotation,MultipleComparison,软件,StatisticalMethod
版本	1.25.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5.0),GenomicRanges
进口	平行,gtable、网格、图形的方法,IRanges,fda KernSmoothS4Vectors,统计grDevices跑龙套,工具
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IWTomics_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	IWTomics_1.25.0.zip
macOS二进制(x86_64)	IWTomics_1.25.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IWTomics
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IWTomics
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/IWTomics/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IWTomics/
包下载报告	下载数据