这是发展IVAS的版本;对于稳定的版本版本,请参阅IVAS.。
Bioconducts版本:开发(3.14)
识别影响替代拼接的遗传变体。
作者:Shongyun Han,Sangsoo Kim
维护者:Seonggyun Han
引文(从R内,输入引文(“IVAS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!qualocmamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)#下面初始化buoc devel biocmanager ::安装(版本='devel')biocmanager ::安装(“ivas”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“IVAS”)
PDF. | r script. | IVAs:识别影响替代剪接的遗传变体 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 替代品那不同的亚兴那差异化那基因表达那Generegulation.那免疫学那rnaseq.那回归那SNP.那测序那软件那转录 |
版本 | 2.13.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.1(R-3.2)(6年) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | r(> 3.0.0),基因组法那ggplot2.那BioBase. |
进口 | 多达齐全那LME4.那生物根系那Genomicranges.那绞喉那Foreach.那annotationdbi.那S4Vectors.那Genomeinfodb.那GGFortify.,grdevices,方法,矩阵那生物相投,utils,stats |
链接到 | |
建议 | 生物焦 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | IMAS. |
进口我 | aspediafi. |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | ivas_2.13.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | |
Macos 10.13(高塞拉) | IVAS_2.13.0.TGZ. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/ivas. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包/ IVAS |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/ivas/ |
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