IVAS.

DOI:10.18129 / b9.bioc.ivas.

这是发展IVAS的版本;对于稳定的版本版本,请参阅IVAS.

识别影响替代剪接的遗传变体

Bioconducts版本:开发(3.14)

识别影响替代拼接的遗传变体。

作者:Shongyun Han,Sangsoo Kim

维护者:Seonggyun Han

引文(从R内,输入引文(“IVAS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!qualocmamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)#下面初始化buoc devel biocmanager ::安装(版本='devel')biocmanager ::安装(“ivas”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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PDF. r script. IVAs:识别影响替代剪接的遗传变体
PDF. 参考手册
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细节

Biocviews. 替代品不同的亚兴差异化基因表达Generegulation.免疫学rnaseq.回归SNP.测序软件转录
版本 2.13.0
在生物导体中以来 BIOC 3.1(R-3.2)(6年)
执照 GPL-2
依靠 r(> 3.0.0),基因组法ggplot2.BioBase.
进口 多达齐全LME4.生物根系Genomicranges.绞喉Foreach.annotationdbi.S4Vectors.Genomeinfodb.GGFortify.,grdevices,方法,矩阵生物相投,utils,stats
链接到
建议 生物焦
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源包 ivas_2.13.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13(高塞拉) IVAS_2.13.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/ivas.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ IVAS
包短网址 https://biocumon.org/packages/ivas/
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