检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

这是发展版本的检查;稳定的发布版本,请参阅检查。

建模RNA合成,与RNA-seq数据处理和退化

Bioconductor版本:发展(3.16)

检查(推理合成、加工、降解率从转录组数据)在时间进程RNA-seq数据实验或稳态条件,有或没有新生的RNA的支持数据。

作者:斯特凡诺德Pretis

维护人员:斯特凡诺德Pretis < ste.depo gmail.com >, Mattia可•福尔兰正< Mattia。可•福尔兰正在iit.it >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“检查”)

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文档

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HTML	R脚本	检查——推理合成,从转录组数据处理和降解率
HTML	R脚本	INSPEcT_GUI.html
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,RNASeq,测序,软件,SystemsBiology,TimeCourse
版本	1.27.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 3.6),方法,Biobase,BiocParallel
进口	pROC,deSolve,rootSolve,KernSmooth,gdata,GenomicFeatures,GenomicRanges,IRanges,BiocGenerics,GenomicAlignments,Rsamtools,S4Vectors,GenomeInfoDb,DESeq2,plgem,rtracklayer,SummarizedExperiment,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,闪亮的
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

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源包	INSPEcT_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	INSPEcT_1.27.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	INSPEcT_1.27.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/检查
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/
包下载报告	下载数据