- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- HiTC(开发版)
HiTC
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DOI:10.18129 / B9.bioc.HiTC
这是发展类似的版本HiTC;稳定的发布版本,请参阅HiTC。
高吞吐量染色体构象捕获分析
Bioconductor版本:发展(3.17)
类似的HiTC包开发探索大规模“C”数据,如5 C或高C。专用R类以及质量控制的标准方法,标准化,可视化,同时还提供了进一步的分析。
作者:尼古拉斯的仆人
维护人员:尼古拉斯仆人<尼古拉斯。仆人在curie.fr >
从内部引用(R,回车引用(类似“HiTC”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(类似“HiTC”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(类似“HiTC”)
| R脚本 | 类似使用HiTC高c数据分析 | |
| R脚本 | 类似介绍HiTC包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 嗝,HighThroughputSequencing,测序,软件 |
| 版本 | 1.43.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.10 (r - 2.15)(11年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 2.15.0)、方法IRanges,GenomicRanges |
| 进口 | Biostrings、图形、grDevicesrtracklayer,RColorBrewer,矩阵平行,GenomeInfoDb |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,HiCDataHumanIMR90 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | HiCDataHumanIMR90,HiCDCPlus |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | HiTC_1.43.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HiTC_1.43.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | HiTC_1.43.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | HiTC_1.43.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiTC |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:类似包/ HiTC |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/HiTC/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HiTC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
