爬虫

DOI:10.18129 / B9.bioc.Herper

这是发展爬虫的版本;稳定的发布版本,请参阅爬虫。

爬虫包是一个简单的工具集来安装和管理和环境从R conda包

Bioconductor版本:发展(3.17)

许多数据分析工具在R,但存在于像conda公共存储库。爬虫包提供了一组全面的功能与conda包管理公司系统交互。与爬虫用户可以安装、管理和运行conda包在自己舒适的R会话。爬虫还提供了一个特别的方法来处理外部系统要求R包。人发展与python包conda依赖我们建议使用蛇怪(//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/basilisk.html)在内部支持这些系统要求pre-hoc。

作者:马特·保罗(aut)托马斯·卡罗尔(aut (cre)Doug巴罗斯(aut),凯瑟琳Rozen-Gagnon(施)

维护人员:托马斯·卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“爬虫”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“爬虫”)

HTML	R脚本	快速启动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.9.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0),网状
进口	跑龙套,rjson,withr,统计数据
链接
建议	BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown,seqCNA
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RockefellerUniversity/Herper
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Herper_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)	Herper_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64)	Herper_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Herper
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/爬虫
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Herper/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Herper/
包下载报告	下载数据