HelloRanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.HelloRanges

这是发展HelloRanges版本;稳定版请参见HelloRanges．

向床具用户介绍*Ranges

Bioconductor版本:开发(3.14)

翻译床工具命令行调用到R代码调用函数从Bioconductor *Ranges基础设施。这是为了教育新手Bioconductor用户，并比较两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔·劳伦斯

维护者:Michael Lawrence

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("HelloRanges")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HelloRanges”)

PDF	R脚本	HelloRanges教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，报道，DataImport，GenomeAnnotation，SequenceMatching，测序，软件，VariantAnnotation
版本	1.19.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法,BiocGenerics，S4Vectors(> = 0.17.39),IRanges(> = 2.13.12),GenomicRanges(> = 1.31.10),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenome，GenomicFeatures(> = 1.31.5),VariantAnnotation(> = 1.19.3),Rsamtools，GenomicAlignments(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDb，SummarizedExperiment
进口	docopt，统计，工具，效用
链接
建议	HelloRangesData，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	OMICsPCA
建议我	plyranges
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HelloRanges_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	HelloRanges_1.19.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	HelloRanges_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HelloRanges
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HelloRanges/
软件包下载报告	下载数据