Heatplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.Heatplus

这是发展Heatplus版本;稳定的发布版本,请参阅Heatplus。

热图协变量行和/或列和彩色的集群

Bioconductor版本:发展(3.16)

显示一个矩形的热图(强度图)的数据矩阵。默认情况下,这两个样本(列)和功能(行)矩阵的排序根据分层聚类,和相应的系统树图绘制。可选地,面板用额外的样品信息和功能可以添加到情节。

作者:亚历山大plone(<亚历山大。plone(在ki.se >

维护人员:亚历山大plone(<亚历山大。plone(在ki.se >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“Heatplus”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Heatplus”)

PDF	R脚本	注释和定期的热图
PDF	R脚本	说包来源
PDF	R脚本	老功能(弃用)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,软件,可视化
版本	3.5.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	图形、grDevices统计,RColorBrewer
链接
建议	Biobase,hgu95av2.db,limma
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/alexploner/Heatplus
BugReports	https://github.com/alexploner/Heatplus/issues
取决于我	phenoTest,tRanslatome
进口我
建议我	mtbls2,RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Heatplus_3.5.0.tar.gz
Windows二进制	Heatplus_3.5.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Heatplus_3.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Heatplus
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Heatplus
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Heatplus/
包下载报告	下载数据