HTSFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTSFilter

这是发展HTSFilter版本;稳定版请参见HTSFilter．

筛选复制的高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:开发(3.16)

该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序，以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。

作者:Andrea Rau [cre, aut]，梅丽娜·加洛平[ctb]，吉勒斯·塞吕[ctb]，弗洛伦斯Jaffrézic [ctb]

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("HTSFilter")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HTSFilter”)

超文本标记语言	R脚本	HTSFilter
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，预处理，RNASeq，测序，软件
版本	1.37.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0.0)
进口	刨边机，DESeq2，BiocParallel，Biobase， utils，统计，grDevices，图形，方法
链接
建议	EDASeq，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	coseq
建议我	HTSCluster
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HTSFilter_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	HTSFilter_1.37.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	HTSFilter_1.37.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HTSFilter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
软件包下载报告	下载数据