HPAanalyze

DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAanalyze

这是发展HPAanalyze版本;稳定的发布版本,请参阅HPAanalyze。

从人类的蛋白质图谱检索和分析数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

提供检索功能,探索人类蛋白质图谱数据分析和可视化。

作者:安一Tran (aut (cre)

维护人员:安一Tran < trannhatanh89 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HPAanalyze”)

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文档

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browseVignettes (“HPAanalyze”)

HTML	R脚本	1。快速启动指南:获取和想象人类的蛋白质图谱(HPA)与HPAanalyze数据在一个函数
HTML	R脚本	2。深入:处理人类蛋白质图谱(HPA)数据与HPAanalyze R
HTML	R脚本	3所示。教程:把HPAanalyze与你们人类蛋白质图谱(HPA)查询
HTML	R脚本	4所示。教程:使用人类的蛋白质图谱(HPA)的xml文件离线
HTML	R脚本	5。教程:出口人类蛋白质图谱(HPA)数据为JSON
HTML	R脚本	6。教程:下载组织学图像从人类蛋白质图谱
HTML	R脚本	99年。代码的数据HPAanalyze纸
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBiology,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.17.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	dplyr,openxlsx,ggplot2,宠物猫,xml2,统计,跑龙套,gridExtra
链接
建议	knitr,rmarkdown,减价,devtools,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/anhtr/HPAanalyze
BugReports	https://github.com/anhtr/HPAanalyze/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HPAanalyze_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	HPAanalyze_1.17.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	HPAanalyze_1.17.0.tgz
macOS二进制(arm64)	HPAanalyze_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAanalyze
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HPAanalyze
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/HPAanalyze/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HPAanalyze/
包下载报告	下载数据