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- Bioconductor 3.17
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- HPAStainR(开发版)
HPAStainR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAStainR
这是发展HPAStainR版本;稳定的发布版本,请参阅HPAStainR。
查询人类蛋白质图谱染色数据为多个蛋白质和基因
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包是围绕HPAStainR函数构建的。HPAStainR功能是查询的目的视觉染色人类蛋白质图谱返回一个表中的数据排名染色细胞类型。函数也有多个参数输出以及个性化包括癌症数据,csv可读名称,修改结果和更高的信心水平。其他功能存在只轻松地获得所需的数据HPAStainR运行。
作者:蒂姆·o·Nieuwenhuis (aut (cre)
维修工:蒂姆·o·Nieuwenhuis < tnieuwe1 jhmi.edu >
从内部引用(R,回车引用(“HPAStainR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HPAStainR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“HPAStainR”)
| HTML | R脚本 | HPAStainR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,GeneSetEnrichment,软件 |
| 版本 | 1.9.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.1.0),dplyr,tidyr |
| 进口 | 跑龙套,统计数据,尺度,stringr,宠物猫,闪亮的,data.table |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocManager,qpdf,hpar,testthat,rmarkdown |
| SystemRequirements | 4 gb的内存 |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/tnieuwe/HPAstainR |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | HPAStainR_1.9.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HPAStainR_1.9.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | HPAStainR_1.9.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAStainR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HPAStainR |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/HPAStainR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HPAStainR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
