吉他

DOI:10.18129 / B9.bioc.Guitar

这是发展吉他的版本;稳定的发布版本请参见吉他

吉他

生物导体版本:开发(3.13)

该包用于可视化RNA转录标记的相关基因组特征,即转录起始位点、起始密码子、终止密码子和转录结束位点。

作者:杜晓,刘慧,张林,贾孟

维护者:Jia孟< Jia。孟xjtlu.edu.cn >

引文(从R中输入引用(“吉他”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("Guitar")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“吉他”)

PDF R脚本 吉他
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,DataImport,MethylSeq,质量控制,RNASeq,测序,软件,SplicedAlignment,转录
版本 2.7.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证 GPL-2
取决于 GenomicFeatures,rtracklayer,AnnotationDbi,GenomicRanges,magrittr,ggplot2,方法,stats, utils,knitr,dplyr
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 Guitar_2.7.0.tar.gz
Windows二进制 Guitar_2.7.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) Guitar_2.7.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Guitar
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/吉他
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Guitar/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网