GmicR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GmicR

这是发展GmicR版本;稳定的发布版本,请参阅GmicR。

结合WGCNA和伊势亚读数与贝叶斯网络learrning生成基因模组免疫细胞网络(GMIC)

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包使用贝叶斯网络学习来检测模块检测到WGCNA基因和免疫细胞之间的关系定义为伊势亚签名。这是一个假设生成工具。

作者:理查德Virgen-Slane

维修工:理查德Virgen-Slane <旅游房车。在gmail.com BioTools >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GmicR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GmicR”)

HTML	R脚本	GmicR_vignette
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,聚类,GUI,GeneExpression,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,网络,NetworkInference,质量控制,软件,SystemsBiology
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL-2 +文件许可证
取决于
进口	AnnotationDbi,猿,bnlearn,类别,DT,doParallel,foreach,gRbase,GSEABase,粮食,GOstats,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,闪亮的,WGCNA,data.tablegrDevices图形,reshape2统计,跑龙套
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GmicR_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	GmicR_1.13.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	GmicR_1.13.0.tgz
macOS二进制(arm64)	GmicR_1.13.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GmicR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GmicR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GmicR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GmicR/
包下载报告	下载数据