GenomAutomorphism

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomAutomorphism

这是发展GenomAutomorphism版本;稳定的发布版本,请参阅GenomAutomorphism。

计算之间的同构DNA的阿贝尔群的表示

Bioconductor版本:发展(3.18)

这是一个R包之间的同构计算两两对齐从基因组DNA序列表示为元素交换群。在一般的情况下,从一个给定的基因组区域,直到整个基因组人口(从任何物种或密切相关的物种)可以用代数方法表示成一个直接的和循环组或更确切的说阿贝耳p-groups。基本上,我们建议长度为N的多序列比对的代表英国石油公司作为有限阿贝尔群的元素创造的直接和homocyclic阿贝尔群的原动力。

作者:Robersy桑切斯(aut (cre)

维护人员:Robersy桑切斯< genomicmath gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GenomAutomorphism”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenomAutomorphism”)

HTML	R脚本	得到了GenomAutomorphism
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ComparativeGenomics,FunctionalGenomics,MathematicalBiology,MultipleSequenceAlignment,软件
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2)
进口	Biostrings,BiocGenerics,BiocParallel,GenomeInfoDb,GenomicRanges,IRanges、dplyr数据。表、平行doParallel、foreach方法,S4Vectors、统计数字,跑龙套
链接
建议	拼写、rmarkdownBiocStyleknitr testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/genomaths/GenomAutomorphism
BugReports	https://github.com/genomaths/GenomAutomorphism/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GenomAutomorphism_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	GenomAutomorphism_1.3.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	GenomAutomorphism_1.3.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomAutomorphism
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenomAutomorphism
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GenomAutomorphism/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomAutomorphism/
包下载报告	下载数据