遗传

doi:10.18129/b9.bioc.genetonic

这是发展遗传版本;对于稳定版本,请参阅遗传

享受分析和整合差异表达分析和功能富集分析的结果

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包提供了一个闪亮的应用程序,旨在将转录组数据和结果的现有部分组合起来,从而更容易产生有见地的观察和假设 - 结合了交互性和可重复性的好处,例如通过捕获直播期间突出显示的功能和基因集,并创建HTML报告作为文物,其中文本,代码和输出共存。

作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE],Annekathrin Ludt [aut]

维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini

引用(从r内,输入引用(“遗传”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ Genetonic”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Genetonic”)

html R脚本 遗传用户指南
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 注解,,,,差异性,,,,,,,,GUI,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,途径,,,,报告写作,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,可视化
版本 2.1.2
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 4.0.0)
进口 AnnotationDbi,,,,骨干,,,,BS4DASH(> = 2.0.0),循环,,,,色彩空间,,,,颜色,,,,复杂的图像,,,,复合设置,,,,Dendextend,,,,deseq2,,,,dplyr,,,,DT,,,,DynamiCtreCut,,,,expm,,,,GGFORCE,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,go.db,图形,grdevices,网格,Igraph,,,,矩阵, 方法,情节,,,,rcolorbrewer,,,,Rintrojs,,,,rlang,,,,rmarkDown,,,,S4VECTORS,,,,,,,,闪亮的,,,,闪亮,,,,Shinycsssloaders,,,,闪亮的widgets,统计总结性特征,,,,花花公子,,,,tippy,工具,utils,维里迪斯,,,,Visnetwork
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,htmltools,,,,clusterProfiler,,,,巨噬细胞,,,,org.hs.eg.db,,,,马格里特,,,,测试(> = 2.1.0)
系统要求
增强
URL https://github.com/federicomarini/genetonic
BugReports https://github.com/federicomarini/genetonic/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Genetonic_2.1.2.2.tar.gz
Windows二进制 Genetonic_2.1.2.2.zip
MacOS 10.13(高山脉) Genetonic_2.1.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genetonic
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/遗传
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genetonic/
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