这是发展遗传版本;对于稳定版本,请参阅遗传。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包提供了一个闪亮的应用程序,旨在将转录组数据和结果的现有部分组合起来,从而更容易产生有见地的观察和假设 - 结合了交互性和可重复性的好处,例如通过捕获直播期间突出显示的功能和基因集,并创建HTML报告作为文物,其中文本,代码和输出共存。
作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE],Annekathrin Ludt [aut]
维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini
引用(从r内,输入引用(“遗传”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ Genetonic”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Genetonic”)
html | R脚本 | 遗传用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 注解,,,,差异性,,,,去,,,,GUI,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,途径,,,,报告写作,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,可视化 |
版本 | 2.1.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 4.0.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,骨干,,,,BS4DASH(> = 2.0.0),循环,,,,色彩空间,,,,颜色,,,,复杂的图像,,,,复合设置,,,,Dendextend,,,,deseq2,,,,dplyr,,,,DT,,,,DynamiCtreCut,,,,expm,,,,GGFORCE,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,go.db,图形,grdevices,网格,Igraph,,,,矩阵, 方法,情节,,,,rcolorbrewer,,,,Rintrojs,,,,rlang,,,,rmarkDown,,,,S4VECTORS,,,,秤,,,,闪亮的,,,,闪亮,,,,Shinycsssloaders,,,,闪亮的widgets,统计总结性特征,,,,花花公子,,,,tippy,工具,utils,维里迪斯,,,,Visnetwork |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,htmltools,,,,clusterProfiler,,,,巨噬细胞,,,,org.hs.eg.db,,,,马格里特,,,,测试(> = 2.1.0) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/federicomarini/genetonic |
BugReports | https://github.com/federicomarini/genetonic/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Genetonic_2.1.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | Genetonic_2.1.2.2.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Genetonic_2.1.2.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genetonic |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/遗传 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genetonic/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |