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- Bioconductor 3.17
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- GeneStructureTools(开发版)
GeneStructureTools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneStructureTools
这是发展GeneStructureTools版本;稳定的发布版本,请参阅GeneStructureTools。
拼接基因结构操作和分析的工具
Bioconductor版本:发展(3.17)
GeneStructureTools可用于创建在硅片可变剪接事件,并分析潜在影响对功能基因产物。
作者:贝丝信号
维护人员:贝丝信号< b。信号在garvan.org.au >
从内部引用(R,回车引用(“GeneStructureTools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GeneStructureTools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GeneStructureTools”)
| HTML | R脚本 | 介绍GeneStructureTools |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,FunctionalPrediction,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录组 |
| 版本 | 1.19.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年) |
| 许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,data.table,plyr,stringdist,stringr,S4Vectors,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,统计,跑龙套,Gviz,rtracklayer、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GeneStructureTools_1.19.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GeneStructureTools_1.19.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | GeneStructureTools_1.19.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | GeneStructureTools_1.19.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneStructureTools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneStructureTools |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GeneStructureTools/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneStructureTools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
