GeneStructureTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneStructureTools

这是发展GeneStructureTools版本;稳定的发布版本,请参阅GeneStructureTools

拼接基因结构操作和分析的工具

Bioconductor版本:发展(3.17)

GeneStructureTools可用于创建在硅片可变剪接事件,并分析潜在影响对功能基因产物。

作者:贝丝信号

维护人员:贝丝信号< b。信号在garvan.org.au >

从内部引用(R,回车引用(“GeneStructureTools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GeneStructureTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GeneStructureTools”)

HTML R脚本 介绍GeneStructureTools
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,FunctionalPrediction,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录组
版本 1.19.0
Bioconductor自 BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年)
许可证 BSD_3_clause +文件许可证
取决于
进口 Biostrings,GenomicRanges,IRanges,data.table,plyr,stringdist,stringr,S4Vectors,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,统计,跑龙套,Gviz,rtracklayer、方法
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GeneStructureTools_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 GeneStructureTools_1.19.0.zip
macOS二进制(x86_64) GeneStructureTools_1.19.0.tgz
macOS二进制(arm64) GeneStructureTools_1.19.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneStructureTools
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneStructureTools
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GeneStructureTools/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneStructureTools/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网