GateFinder

DOI:10.18129 / B9.bioc.GateFinder

这是发展GateFinder版本;稳定版请参见GateFinder

基于投影的流式和大规模细胞检测门控策略优化

Bioconductor版本:开发(3.17)

给定细胞群的聚类成员向量,识别用于隔离该细胞类型的门序列(2D散点图上的多边形过滤器)。

作者:Nima Aghaeepour , Erin F. Simonds < Erin。西蒙兹在gmail.com>

维护者:Nima Aghaeepour

引文(从R内,输入引用(“GateFinder”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GateFinder")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GateFinder”)

PDF R脚本 GateFinder
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBiology聚类FlowCytometryImmunoOncology软件
版本 1.19.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 splancsmvoutlier,方法,统计,diptestflowCoreflowFP
链接
建议 RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GateFinder_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 GateFinder_1.19.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) GateFinder_1.19.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) GateFinder_1.19.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GateFinder
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GateFinder
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GateFinder/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GateFinder/
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Bioconductor

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支持»

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网