GSgalgoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSgalgoR

这是发展GSgalgoR版本;稳定版请参见GSgalgoR．

癌症预后基因表达特征识别和研究的进化框架

Bioconductor版本:开发(3.17)

基于非支配排序遗传算法的疾病亚型发现多目标优化算法。“Galgo”框架结合了对异构“组学”数据进行分组的聚类算法的优势和用于特征选择的遗传算法的搜索特性。该算法在保持较高的聚类一致性的同时，考虑到各子类型之间的生存差异最大的特征，寻找最优聚类数量的确定。

作者:Martin Guerrero [aut]， Carlos Catania [cre]

维护者:Carlos Catania

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GSgalgoR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GSgalgoR”)

超文本标记语言	R脚本	GSgalgoR.html
超文本标记语言	R脚本	GSgalgoR_callbacks.html
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，聚类，GeneExpression，软件，生存，转录
版本	1.9.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于
进口	集群，doParallel，foreach，matchingR，nsga2R，生存，代理、统计数据、方法
链接
建议	knitr，rmarkdown，ggplot2，BiocStyle，genefu，survcomp，Biobase，survminer，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUPP，iC10TrainingData，pamr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR
BugReports	https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GSgalgoR_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	GSgalgoR_1.9.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	GSgalgoR_1.9.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	GSgalgoR_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSgalgoR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSgalgoR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GSgalgoR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSgalgoR/
软件包下载报告	下载数据