- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- GSReg(开发版)
GSReg
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GSReg
这是发展GSReg版本;稳定的发布版本,请参阅GSReg。
基因设置调节(GS-Reg)
Bioconductor版本:发展(3.17)
一套方案基因分析基于表达式的可变性以及检测可变剪接事件的方法。它实现差动保护等级(狄拉克)和基因表达差异分析(EVA)方法。检测不同拼接基因,它提供了一个实现Spliced-EVA(歌曲)。
作者:Bahman艾弗里< Bahman jhu.edu >,伊莱j .多数< ejfertig jhmi.edu >
维护人员:Bahman艾弗里< Bahman jhu.edu >,伊莱j .多数< ejfertig jhmi.edu >
从内部引用(R,回车引用(“GSReg”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GSReg”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GSReg”)
| R脚本 | 使用GSReg包 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,GeneExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GeneticVariability,通路,软件 |
| 版本 | 1.33.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.13.1),Homo.sapiens,org.Hs.eg.db,GenomicFeatures,AnnotationDbi |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | GenomicRanges,GSBenchMark |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GSReg_1.33.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GSReg_1.33.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | GSReg_1.33.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | GSReg_1.33.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSReg |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSReg |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GSReg/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GSReg/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
