GSRI

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSRI

这是发展GSRI版本;稳定版请参见GSRI．

基因集调控指数

Bioconductor版本:开发(3.17)

GSRI包估计基因集中差异表达基因的数量，利用基因集调控指数(GSRI)的概念。

作者:Julian Gehring, Kilian Bartholome, Clemens Kreutz, Jens Timmer

维护者:Julian Gehring

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GSRI")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GSRI”)

PDF	R脚本	介绍GSRI包:利用基因集调控指数估计调控效应
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，微阵列，软件，转录
版本	2.47.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(13年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.14.2)，fdrtool
进口	方法，图形，统计，utils，genefilter，Biobase，GSEABase，莱斯(> = 1.1.6)
链接
建议	limma，hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了	平行
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GSRI_2.47.0.tar.gz
Windows二进制	GSRI_2.47.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	GSRI_2.47.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	GSRI_2.47.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSRI
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSRI
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GSRI/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSRI/
软件包下载报告	下载数据