GSRI

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSRI

这是发展GSRI版本;稳定版请参见GSRI

基因集调控指数

Bioconductor版本:开发(3.17)

GSRI包估计基因集中差异表达基因的数量,利用基因集调控指数(GSRI)的概念。

作者:Julian Gehring, Kilian Bartholome, Clemens Kreutz, Jens Timmer

维护者:Julian Gehring

引文(从R内,输入引用(“GSRI”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GSRI")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GSRI”)

PDF R脚本 介绍GSRI包:利用基因集调控指数估计调控效应
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneRegulationGeneSetEnrichment微阵列软件转录
版本 2.47.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(13年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.14.2),fdrtool
进口 方法,图形,统计,utils,genefilterBiobaseGSEABase莱斯(> = 1.1.6)
链接
建议 limmahgu95av2.db
SystemRequirements
增强了 平行
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GSRI_2.47.0.tar.gz
Windows二进制 GSRI_2.47.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) GSRI_2.47.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) GSRI_2.47.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSRI
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSRI
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GSRI/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSRI/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网