GSCA

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSCA

这是发展GSCA版本;稳定版请参见GSCA．

GSCA:基因集上下文分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

GSCA以激活和抑制基因列表作为输入。然后，GSCA通过公开可用的基因表达谱的概要来搜索含有特定基因表达模式的生物背景。GSCA提供了传统的R函数和交互式的、用户友好的用户界面。

作者:纪志成，纪鸿凯

维护者:zhiicheng Ji

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GSCA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GSCA”)

PDF	R脚本	GSCA
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI,GeneExpression,软件,可视化
版本	2.29.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(9年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	闪亮的,sp,gplots,ggplot2,reshape2,RColorBrewer,rhdf5， r (>= 2.10.0)
进口	图形
链接
建议	Affyhgu133aExpr,Affymoe4302Expr,Affyhgu133A2Expr,Affyhgu133Plus2Expr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GSCA_2.29.0.tar.gz
Windows二进制	GSCA_2.29.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	GSCA_2.29.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	GSCA_2.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSCA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSCA
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GSCA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSCA/
软件包下载报告	下载数据