GSAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSAR

这是发展GSAR版本;稳定版请参见GSAR

基因集分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

使用特定的替代假设进行基因集分析。微分表达式、量表和净相关结构的检验。

作者:Yasir Rahmatallah , Galina Glazko

维护者:Yasir Rahmatallah , Galina Glazko

引文(从R内,输入引用(“GSAR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GSAR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GSAR”)

PDF R脚本 R中的基因集分析——GSAR包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression软件StatisticalMethod
版本 1.31.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(7.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.0.1),igraph(> =是0.7.1)
进口 统计数据、图形
链接
建议 质量GSVAdata所有tweeDEseqCountDataGSEABase注释org.Hs.eg.dbBiobasegenefilterhgu95av2.db刨边机BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GSAR_1.31.0.tar.gz
Windows二进制 GSAR_1.31.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra) GSAR_1.31.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSAR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSAR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSAR/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网