- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- GRridge(开发版)
GRridge
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GRridge
这是发展GRridge版本;稳定的发布版本,请参阅GRridge。
更好的预测使用co-data:自适应group-regularized岭回归
Bioconductor版本:发展(3.16)
这个包允许使用多个来源的co-data(例如外部假定值、基因列表、注释)来提高预测的二进制,连续和生存反应使用(物流、线性或Cox) group-regularized岭回归。它还促进了因果变量选择和交叉验证使用ROC曲线和AUC预测诊断。
作者:Mark a . van de由<马克。在vumc.nl vdwiel >,Putri W. Novianti
维修工:马克a van de由<马克。在vumc.nl vdwiel >
从内部引用(R,回车引用(“GRridge”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GRridge”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GRridge”)
| R脚本 | GRridge | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯,分类,去,GeneExpression,GenePrediction,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,KEGG,通路,RNASeq,回归,软件,生存 |
| 版本 | 1.21.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.2),处罚,Iso,生存、方法、图统计数据,glmnet,mvtnorm |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GRridge_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GRridge |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GRridge |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GRridge/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
