GOstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOstats

这是发展GOstats版本;稳定版请参见GOstats．

用于操作GO和微阵列的工具

Bioconductor版本:开发(3.16)

一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本操作工具的图形，假设检验和其他简单的计算。

作者:Robert Gentleman [aut]， Seth Falcon [ctb]， Robert Castelo [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GOstats")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GOstats”)

PDF	R脚本	不常见模式生物的超几何试验
PDF	R脚本	使用GOstats的超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats可视化数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，去，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，微阵列，MultipleComparison，通路，软件
版本	2.63.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图
进口	方法，stats stats4，AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL，注释(> = 1.13.2),AnnotationForge，Rgraphviz
链接
建议	hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有，乘，genefilter，RColorBrewer，xtable，SparseM，GSEABase，geneplotter，org.Hs.eg.db，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	MineICA，PloGO2
进口我	affycoretools，吸引，categoryCompare，GmicR，理想的，MIGSA，miRLAB，netZooR，pcaExplorer，ReportingTools，scTensor
建议我	a4，类别，fastLiquidAssociation，fgga，GSEAlm，interactiveDisplay，MineICA，中长期规划，qpgraph，RnBeads，安全
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GOstats_2.63.0.tar.gz
Windows二进制	GOstats_2.63.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GOstats_2.63.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOstats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOstats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GOstats/
软件包下载报告	下载数据