GNET2

DOI:10.18129 / B9.bioc.GNET2

这是发展GNET2版本;稳定版请参见GNET2．

通过功能模块推理从表达数据构建基因调控网络

Bioconductor版本:开发(3.17)

通过E-M过程将基因聚成功能基团。迭代执行TF赋值和Gene赋值，直到基因赋值不变或达到最大迭代次数。

作者:陈晨，侯杰，程建林

维护者:陈晨

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GNET2")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GNET2”)

超文本标记语言	R脚本	用GNET2构建功能基因模块
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，网络，NetworkInference，回归，软件
版本	1.15.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	Apache License 2.0
取决于	R (>= 3.6)
进口	ggplot2，xgboost，Rcpp，reshape2、网格图，方法，统计，matrixStats、图形、SummarizedExperiment，dplyr，igraph， grDevices, utils
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/chrischen1/GNET2
BugReports	https://github.com/chrischen1/GNET2/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GNET2_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	GNET2_1.15.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	GNET2_1.15.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	GNET2_1.15.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GNET2
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GNET2
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GNET2/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GNET2/
软件包下载报告	下载数据